藥學(xué)專業(yè)于2005年獲教育部批準(zhǔn)，2006年正式招生。該專業(yè)以化學(xué)和生物學(xué)兩大學(xué)科為基礎(chǔ)，目標(biāo)是為祖國制藥工業(yè)和藥物研究機(jī)構(gòu)培養(yǎng)具有扎實(shí)藥學(xué)基礎(chǔ)理論和基本技能的、能夠從事創(chuàng)新藥物研究的專門技術(shù)人才。

本專業(yè)師資力量雄厚，主要為海外引進(jìn)人才及共建單位的知名學(xué)者等25位教師，其中教授13名（均為博士生導(dǎo)師）包括國家973首席科學(xué)家1名、上海市領(lǐng)軍人才1名、國家杰出青年科學(xué)基金獲得者2名、教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才3名、校特聘教授5名、校講座教授5名；副教授8名，講師 7 名。學(xué)科分布涉及生物物理化學(xué)、藥物設(shè)計(jì)、藥物化學(xué)、藥物篩選、藥理學(xué)、化學(xué)生物學(xué)等。現(xiàn)正承擔(dān)國家973計(jì)劃、863計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金、教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計(jì)劃、上海市浦江人才計(jì)劃、上海市科委重點(diǎn)基礎(chǔ)研究等科研項(xiàng)目40余項(xiàng)。

主要學(xué)科帶頭人蔣華良教授是我國著名的藥物化學(xué)家，國家973計(jì)劃首席科學(xué)家，中國科學(xué)院上海藥物研究所副所長、藥物發(fā)現(xiàn)與設(shè)計(jì)中心主任，藥學(xué)院現(xiàn)任院長；錢旭紅教授是我國著名的農(nóng)藥學(xué)專家，國家973計(jì)劃首席科學(xué)家，華東理工大學(xué)現(xiàn)任校長。

本專業(yè)的特色主要有三個(gè)：一是遵循從基因到藥物的原理，培養(yǎng)學(xué)生從源頭入手（從基因入手和從小分子化合物入手）進(jìn)行創(chuàng)新藥物研究的能力。二是理工結(jié)合，與國外大學(xué)藥學(xué)教育模式相一致。既充分發(fā)揮華東理工大學(xué)在化學(xué)、化工、生物、生工以及制藥工程、中藥現(xiàn)代化工程、農(nóng)藥等學(xué)科專業(yè)的獨(dú)特優(yōu)勢，同時(shí)又依托中國科學(xué)院上海藥物研究所創(chuàng)新藥物研究的強(qiáng)大實(shí)力，以培養(yǎng)研究型藥學(xué)人才為主又具有理工結(jié)合的特色。三是強(qiáng)調(diào)國際性。借助于本專業(yè)師資力量所具備的年輕（大都是40歲左右）、高學(xué)位（大都是博士）、國際化（大都具有海外留學(xué)經(jīng)歷）等特點(diǎn)，吸收國內(nèi)外先進(jìn)教學(xué)經(jīng)驗(yàn)，努力提高藥學(xué)學(xué)科建設(shè)的國際化水平；從三年級開始，實(shí)行本科生導(dǎo)師輪流制，通過真正接觸課題研究來培養(yǎng)學(xué)生個(gè)性化學(xué)習(xí)興趣；同時(shí)經(jīng)常邀請國外專家來華進(jìn)行短期講學(xué)，使學(xué)生們盡早接觸學(xué)科國際前沿，使學(xué)生在語言和專業(yè)方面具備國際交流能力。

本專業(yè)的主干學(xué)科是化學(xué)、生物學(xué)和藥學(xué)。主要課程包括：現(xiàn)代基礎(chǔ)化學(xué)、有機(jī)化學(xué)、物理化學(xué)、生物化學(xué)、藥物化學(xué)、天然藥物化學(xué)、微生物學(xué)、分子生物學(xué)、藥理學(xué)、藥物分析、藥物篩選、藥物設(shè)計(jì)學(xué)、藥學(xué)文獻(xiàn)檢索、藥學(xué)專業(yè)實(shí)驗(yàn)等。

本專業(yè)畢業(yè)生的主要去向有：出國或報(bào)考藥學(xué)或相關(guān)專業(yè)的研究生，進(jìn)一步深造；可到科研院所或制藥企業(yè)從事新藥研究或藥品檢驗(yàn)；可到相關(guān)院校從事藥學(xué)教學(xué)等。

本專業(yè)學(xué)制四年，學(xué)生達(dá)到教學(xué)要求后，可獲得本科畢業(yè)證書和理學(xué)學(xué)士學(xué)位證書。