藥學專業(yè)于2005年獲教育部批準，2006年正式招生。該專業(yè)以化學和生物學兩大學科為基礎，目標是為祖國制藥工業(yè)和藥物研究機構培養(yǎng)具有扎實藥學基礎理論和基本技能的、能夠從事創(chuàng)新藥物研究的專門技術人才。

本專業(yè)師資力量雄厚，主要為海外引進人才及共建單位的知名學者等35位教師，其中教授16人（均為博士生導師），副教授12人，講師7人。博士學位比例為100%，具有海外留學背景的比例高于65%。其中國家杰出青年科學基金獲得者2名、國家優(yōu)青3名、國家青年拔尖人才1名、國家科技創(chuàng)新領軍人才1名、教育部新世紀人才5名。學科分布涉及生物物理化學、藥物設計、藥物化學、藥物篩選、藥理學、化學生物學等。現(xiàn)正承擔國家973計劃、863計劃、國家自然科學基金、教育部新世紀優(yōu)秀人才支持計劃、上海市浦江人才計劃、上海市科委重點基礎研究等科研項目40余項。

主要學科帶頭人蔣華良教授是我國著名的藥物化學家，國家973計劃首席科學家，中國科學院上海藥物研究所所長、藥物發(fā)現(xiàn)與設計中心主任；錢旭紅教授是我國著名的農藥學專家，國家973計劃首席科學家。

本專業(yè)的特色主要有三個：一是遵循從基因到藥物的原理，培養(yǎng)學生從源頭入手（從基因入手和從小分子化合物入手）進行創(chuàng)新藥物研究的能力。二是理工結合，與國外大學藥學教育模式相一致。既充分發(fā)揮華東理工大學在化學、化工、生物、生工以及制藥工程、中藥現(xiàn)代化工程、農藥等學科專業(yè)的獨特優(yōu)勢，同時又依托中國科學院上海藥物研究所創(chuàng)新藥物研究的強大實力，以培養(yǎng)研究型藥學人才為主又具有理工結合的特色。三是強調國際性。借助于本專業(yè)師資力量所具備的年輕（大都是40歲左右）、高學位（大都是博士）、國際化（大都具有海外留學經歷）等特點， 吸收國內外先進教學經驗，努力提高藥學學科建設的國際化水平；從三年級開始，實行本科生導師輪流制，通過真正接觸課題研究來培養(yǎng)學生個性化學習興趣；同時經常邀請國外專家來華進行短期講學，使學生們盡早接觸學科國際前沿，使學生在語言和專業(yè)方面具備國際交流能力。

本專業(yè)的主干學科是化學、生物學和藥學。主要課程包括：現(xiàn)代基礎化學、有機化學、物理化學、生物化學、藥物化學、天然藥物化學、微生物學、分子生物學、藥理學、藥物分析、藥物篩選、藥物設計學、藥學文獻檢索、藥學專業(yè)實驗等。

本專業(yè)畢業(yè)生的主要去向有：出國或報考藥學或相關專業(yè)的研究生，進一步深造；可到科研院所或制藥企業(yè)從事新藥研究或藥品檢驗；可到相關院校從事藥學教學等。

本專業(yè)學制四年，學生達到教學要求后，可獲得本科畢業(yè)證書和理學學士學位證書。